医院污水水质类似于生活污水，但成份复杂。如消毒剂，来自化验、检验、手术等各科室的重金属、有机试剂，以及可能的放射性同位素等。作为医院，其排放的污水中含有大量有毒化学物质和多种致病菌、病毒和寄生虫卵。它们在环境中具有一定的适应能力，有的甚至在污水中存活时间较长，若未处理或处理不当即排入水体或用于灌溉，将会污染环境，影响人们的身体健康。参考同类废水，其指标如下：
名称 | CODcr（mg/L） | BOD5（mg/L） | SS（mg/L） | 氨（mg/L） | 大肠杆菌（个 /L） |
废水含量 | 150～300 | 80～150 | 40～120 | 10～50 | 1.0×106~3.0×108 |
平均值 | 250 | 100 | 80 | 30 | 1.6×108 |
医院废水经过格栅拦截，去除大块漂浮物和颗粒物质后，出水自流入调节池，均衡水质水量，出水经过污水泵抽入A级生物池，A级生物池内废水在厌氧菌作用下，大分子有机物被分解成为小分子有机物，提高废水的可生化性，减小后续好氧处理运行负荷；出水自流入O级生物池，好氧微生物利用水中的有机污染物为底物进行好氧代谢，使有机物以低能位的无机物稳定下来，达到无害化的过程，出水自流入二沉池，利用重力作用进行泥水分离，出水自流入消毒池，投加二氧化氯，进行消毒，经过消毒后的污水，直接达标排放。
